עבור משתמשים רבים, מקלות USB הם האמצעי האידיאלי למטרה: מקלות USB קטנים, זולים ומציעים הרבה מקום אחסון. אין פלא שפחות ופחות תקליטורים ו- DVD נשרפים. אך בכל הנוגע לעיצוב של כרטיס USB, יש לקחת בחשבון כמה דברים
ככלל, עליך לאתחל את מקלות ה- USB שלך עם מערכת הקבצים FAT32: מערכת קבצים זו לא מוכרת רק על ידי Windows 7, Windows Vista ו- Windows XP, אלא גם על ידי מחשבים עם Mac OS X ו- Linux.
היתרון עם FAT32, לעומת זאת, הוא שקובץ אינו יכול להיות גדול מ -4 ג'יגה -בייט. אמנם קשה יחסית לדלג על מכשול זה וקל לעקוף אותו, אך חסרון נוסף הוא הרבה יותר משמעותי: מקלות USB עשויים להיות בעלי נפח אחסון מקסימלי של 32 ג'יגה -בתים אם הם יהיו מעוצבים ב- FAT32. מקלות USB עם נפח אחסון של יותר מ -32 ג'יגה הם עדיין עדיין יקרים יחסית, אך המחירים ממשיכים לרדת, לכן עליך לזכור את מגבלת הגודל הזו.
ל- ExFAT אין הגבלות על גודל הקבצים או על קיבולת האחסון הכללית של מקל USB: מיקרוסופט הציגה מערכת קבצים זו עם Windows 7, כך ש- ExFAT נתמך רק על ידי Windows 7 כסטנדרט. מצד שני, תחת Windows Vista אתה צריך Service Pack 1, שאיתו משודרגת התמיכה ב- ExFAT. מיקרוסופט פרסמה עדכון נפרד עבור Windows XP כך שניתן להשתמש במקלות USB עם ExFAT כמערכת הקבצים: http://support.microsoft.com/kb/955704
מצד שני, היינו מייעצים לחלוטין ל- FAT: מערכת קבצים זו מיושנת כעת, כך שכדאי שלא להשתמש בה יותר. ל- NTFS יש גם מספר חסרונות, מכיוון שמערכות עם Mac OS X כמערכת ההפעלה בדרך כלל יכולות לקרוא מקלות USB כאלה, אך אינן יכולות לכתוב להן קבצים.
